El 16 de octubre de 1880 se formó la primera comunidad de Esclavas en Córdoba, el Obispo de la ciudad les cedió la iglesia de San Juan de los Caballeros. El  3 de Octubre de 1881 se abrió una escuela gratuita para niñas de familias con pocos recursos. Las hermanas habilitaron como clases una de las naves de la iglesia.

Empezó a funcionar un centro de pago. Al principio se daban clases particulares. En 1934 se convertirá en un colegio externado, con la estructura exigida por las leyes del momento.

En el año escolar 1935-36 empezó su actividad el centro Sagrado Corazón, así consta en el Boletín Oficial de la Provincia de Córdoba del 18 de junio de 1936.  En este año se comenzó a recibir alumnas mediopensionistas y, en 1938, alumnas internas.

Las clases y la comunidad se trasladaron a la calle Encarnación y se empezaron las obras de remodelación del edificio de la Plaza de San Juan.

Se reanudaron las clases en el nuevo edificio de la Plaza San Juan. Durante un tiempo, en el mismo lugar, funcionaron el colegio Sagrado Corazón y un centro de patronato, denominado «San Francisco Javier y Santa Teresa». Siguiendo las indicaciones del Concilio Vaticano II, ambos centros se fundieron en el curso 1968 -1969.

En la calle Barroso, en el antiguo colegio «Cultura Española», se construye un parvulario que se abrirá en abril de 1978. El BOE reconoce al colegio Sagrado Corazón como centro homologado, con unidades en parvulario, E.G.B. y B.U.P.

De acuerdo con las sucesivas leyes educativas, se fueron conformando, además de la Enseñanza Primaria, las Enseñanzas Medias – Bachiller Elemental y Superior, primero E.G.B. y B.U.P. y después C.0.U. Finalmente el 17 de mayo de 1986 se accede al sistema de subvenciones con la administración firmándose el primer concierto educativo.

En 1996 entra en vigor la LOGSE y el nuevo Bachillerato.

Quedan concertadas todas las etapas educativas, excepto el Bachillerato. En el año 2013 nuestro centro pasó a formar parte de la Fundación Educativa ACI que reúne a todos los colegios de España.